Cell-free DNA یا cfDNA
چرا cfDNA اهمیت ویژهای دارد؟
برخلاف DNA ژنومی که از سلولها استخراج میشود، cfDNA نمایانگر اطلاعات ژنتیکی بهروز و پویا از وضعیت بدن است. به همین دلیل، تحلیل cfDNA میتواند امکان تشخیص زودهنگام بیماریها، پایش پاسخ به درمان و بررسی جهشهای ژنتیکی را بدون نیاز به نمونهبرداری تهاجمی فراهم کند. اما این مزایا تنها زمانی قابل دستیابی هستند که cfDNA با کیفیت، خلوص و بازده مناسب استخراج شود.
چالشهای اصلی در استخراج cfDNA
استخراج cfDNA یکی از حساسترین مراحل در کل فرآیندهای مولکولی محسوب میشود. مهمترین چالشها در این مرحله عبارتاند از:
- غلظت بسیار پایین cfDNA
cfDNA معمولاً در مقادیر بسیار کم در پلاسما یا سرم وجود دارد. این موضوع باعث میشود که حتی خطاهای جزئی در فرآیند استخراج، منجر به از دست رفتن بخش قابلتوجهی از نمونه شود. - خطر آلودگی با DNA ژنومی سلولی
در صورت لیز شدن سلولهای خونی یا استفاده از روشهای نامناسب، DNA ژنومی سلولی میتواند وارد نمونه شود و نتایج آنالیز را مخدوش کند. این آلودگی یکی از دلایل اصلی نتایج کاذب در تستهای مبتنی بر cfDNA است. - حساسیت بالا به مهارکنندهها
وجود مهارکنندههای PCR یا ترکیبات باقیمانده از مراحل استخراج، میتواند حساسیت تستهای downstream را بهشدت کاهش دهد، بهویژه در روشهایی مانند Real-Time PCR یا sequencing. - تخریب مولکولی و کاهش یکپارچگی DNA
cfDNA ذاتاً قطعات کوتاهی دارد و استفاده از ترکیبات نامناسب یا شرایط استخراج خشن میتواند باعث تخریب بیشتر آن و کاهش قابلیت شناسایی شود.
چرا روش استخراج اهمیت دارد؟
روشهای متداول استخراج DNA که برای نمونههای سلولی طراحی شدهاند، معمولاً برای cfDNA مناسب نیستند. استخراج cfDNA نیازمند رویکردی است که:
- بازیابی بالا از حجم کم نمونه را تضمین کند
- آلودگی DNA سلولی را به حداقل برساند
- از تخریب مولکولی جلوگیری کند
- با تستهای حساس مولکولی کاملاً سازگار باشد
به همین دلیل، استفاده از فناوریهای اختصاصی مانند روشهای مغناطیسی با نانوذرات تخصصی، به یکی از رویکردهای استاندارد در استخراج cfDNA تبدیل شده است.
رویکرد آرسام نوژن در استخراج cfDNA
در آرسام نوژن، طراحی کیت استخراج cfDNA با تمرکز بر همین چالشها انجام شده است. این کیت بهگونهای طراحی شده که امکان بازیابی سریع و دقیق cfDNA از پلاسما یا سرم را فراهم کند، بدون آنکه DNA ژنومی سلولی یا مهارکنندهها در نمونه نهایی باقی بمانند. استفاده از ترکیبات غیرسمی، حفظ یکپارچگی مولکولی و سازگاری کامل با کاربردهای حساس مولکولی، از اصول کلیدی در توسعه این محصول بوده است.
نگاه به آینده
با گسترش استفاده از Liquid Biopsy و روشهای تشخیص غیرتهاجمی، اهمیت استخراج cfDNA بیش از پیش افزایش خواهد یافت. انتخاب یک روش استخراج مناسب، نهتنها کیفیت نتایج آزمایش، بلکه اعتبار کل فرآیند تشخیصی یا تحقیقاتی را تعیین میکند. در ادامه، بهصورت تخصصیتر به راهحلهای استخراج cfDNA و ویژگیهای فنی این رویکردها پرداخته خواهد شد.
برای اطلاعات بیشتر در مورد محصولات مرتبط، به وبلاگ آرسام نوژن مراجعه کنید یا با ما تماس بگیرید.
بدون دیدگاه